对16岁未成年人强奸罪的刑期，会在3-10年基础上从轻或减轻。《刑法》规定，未成年强奸妇女应从轻或减轻处罚，不及时处理可能导致受害者心理创伤加深。
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未成年强奸刑期判定需视情况。操作如下：1.收集证据，确保充分；2.报警并由警方立案调查；3.走司法程序，考虑未成年因素，法院会从轻或减轻处罚；4.关注受害者心理，提供必要援助。
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处理此类案件，常见方式有起诉、调解等。应根据案情严重性及受害者意愿选择，严重案件应坚决起诉，保护受害者权益。